Rügen ist von einer Kette solcher Bodden umgeben, die die Insel tief zergliedern und eine einzigartige Küstenlinie schaffen. Zu den bekanntesten gehören der Große und Kleine Jasmunder Bodden, der Greifswalder Bodden im Süden sowie die Rügenschen Binnenbodden im Westen. Diese Gewässer sind nicht nur landschaftlich reizvoll, sondern auch ökologisch von großer Bedeutung. Ihre ausgedehnten Schilfgürtel und Seegraswiesen sind wichtige Laichgebiete für Fische wie Hecht und Zander und bieten unzähligen Vogelarten Lebensraum und Nahrung.
Die Bodden sind ein Paradies für Wassersportler. Segler, Surfer und Kitesurfer schätzen die meist ruhigeren Bedingungen im Vergleich zur offenen See. Auch für Angler sind die fischreichen Gewässer ein beliebtes Revier. Entlang der Ufer führen zahlreiche Rad- und Wanderwege, die immer wieder neue, malerische Ausblicke auf die stille Wasserlandschaft freigeben. Die kleinen, verträumten Fischerdörfer an den Boddenufern haben sich oft einen sehr ursprünglichen Charme bewahrt.